Les halles datent du XIV^e siècle (1376-1377). Elles occupent le centre-ville et s’étendent de la rue Saint-Jacques à l’extrémité sud de la place Notre-Dame. Sans nul doute, sur cet emplacement s’est toujours tenu un marché établi par les seigneurs du lieu, à proximité de leur château. La charpente des halles est constituée de trois essences de bois différents : chêne, châtaignier, sapin. C’est l’un des rares édifices clissonnais préservés lors des guerres de Vendée car les lieux ont servi d’abri et de campement, aussi bien pour les troupes républicaines, que pour les troupes royalistes.